Bioinformatik Nebenfach Diplom

Stand: 18.09.2008, Stefan Rensing


Wer Biologie studiert und Interesse an Bioinformatik hat, ist auf dieser Seite richtig !
(Die Infos sind jedoch auch für Informatiker mit Nebenfach/Schwerpunkt Bioinformatik interessant)

Seit dem Wintersemester 2000/2001 kann man als Biologe offiziell das biologische Nebenfach Bioinformatik in Freiburg studieren.
Die Voraussetzung hierfür war früher, dass man als nichtbiologisches Nebenfach Informatik studiert und dass man eine Programmiersprache beherrscht.

Dies wird weiterhin empfohlen, jedoch wurde die obligatorische Kopplung im Juli 2005 aufgehoben.



Die Anforderungen für das biologische Nebenfach Bioinformatik sind:

- Ein Bioinformatik-Kurs oder Praktikum (auch extern)
- Ein Oberseminar in Bioinformatik
- Zwei Vorlesungen mit Übungen zur Bioinformatik

Welche B.Sc./M.Sc. Veranstaltungen kommen in Frage? Siehe hierzu die Tabelle auf meiner Lehrseite.


Die Anforderungen für das nichtbiologische Nebenfach Informatik sind:

- Vorlesung mit Übungen Informatik für das Nebenfach I
- Vorlesung mit Übungen Informatik für das Nebenfach II



Prüfungen und Prüfungsinhalte:
Der Inhalt der o.g. Literatur bzw. Schwerpunkte nach Absprache sind Prüfungsinhalte.
Derzeit kann man sich bei folgenden Personen prüfen lassen: Aertsen, Baumeister, Hess, Lebiedz, Rensing, Rotter, Schulze.


Weitergehende Informationen:

Die Informationen zu meinen Lehrveranstaltungen und zur Sprechstunde finden Sie hier.

Die homepages der AGs Aertsen, Baumeister, Hess, Lebiedz, Rensing, Rotter.


Fächerkombinationen:
Natürlich gibt es Fächer, die sich anbieten, und eher exotische Kombinationen - wichtig ist, dass ein Sinn dahinter steckt. Bioinformatik wird in allen biologischen Disziplinen betrieben, daher kann im Prinzip jedes Fach Sinn machen.



Empfohlene Literatur:

Die Absprache über die relevante Literatur muss mit dem jeweiligen Prüfer erfolgen!

"Bioinformatik - Ein Leitfaden für Naturwissenschaftler" von Andrea Hansen (erschienen bei Birkhäuser 2001 - inzwischen gibt es eine neue Auflage!) ist eine kurze aber prägnante Einführung vor allem in alignments, Homologiesuche und Phylogenie. Kann man z.B. bei amazon bestellen.

"Bioinformatics" von D. Mount (erschienen bei CSHL Press 2004, 2. edition) ein recht umfassendes Buch, in dem alle Grundlagen erklärt werden. Kann man z.B. bei amazon bestellen.

"Bioinformatics - A practical guide to the analysis of genes and proteins" von A.D. Baxevanis und B.F.F. Ouellette (erschienen bei Wiley 2001) ist eine sehr gute Einführung vor allem in Sequenzdatenbanken, alignments, Homologiesuche und Phylogenie.

"Developing Bioinformatics Computer Skills" von C. Gibas und P. Jambeck (erschienen bei O'Reilly 2001) ist ein ausführliches Kompendium, das sich mit den nötigen Bioinformatik-Kenntnissen für Molekularbiologie befasst. Siehe auch O'Reilly

"Biological sequence analysis" von R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh und G. Mitchison (erschienen bei Cambridge University Press 1998) befasst sich mit alignment, Phylogenie und HMMs (Hidden Markov Models).

"Bioinformatics - The Machine Learning Approach" von P. Baldi und S. Brunak (erschienen bei MIT Press 2001, 2. edition) befasst sich mit probabilistischen Modellen, neuronalen Netzen, HMMs, genetischen Algorithmen, microarrays u.a. mehr.


 

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